AIDD·Atlas AI 制药学习地图
040

Scaffold 骨架:药物化学为什么重视母核

骨架是分子的核心环系框架,药物化学围绕骨架组织 SAR、做骨架跃迁,是理解系列化合物的关键视角。

骨架(scaffold)指一个分子的核心框架——通常是它的环系与连接环的部分。药物化学家习惯围绕骨架来组织和理解一系列化合物。

为什么骨架重要

  • 组织 SAR:同一骨架、不同取代基的系列,便于比较活性变化(构效关系)。
  • 知识产权:新颖骨架往往意味着新的化学空间与专利空间。
  • 骨架跃迁(scaffold hopping):在保持关键相互作用的前提下更换母核,是优化与规避专利的重要手段。

在 AI 流程里的作用

  • 数据划分:按骨架划分训练/测试集,更真实地评估泛化(见 051)。
  • 多样性:统计骨架分布,判断库是否过于集中。
  • 生成约束:可要求生成模型跳出已有骨架。

关键要点

  • 骨架 = 分子的核心环系框架;
  • 药化围绕骨架组织 SAR、做骨架跃迁;
  • AI 里用于划分、多样性与生成约束。

延伸资源

  • 深入:041《Bemis–Murcko Scaffold》、051《Scaffold Split》。
  • 「实战流程」模块:Scaffold Hopping 实战。