R-group Decomposition(R 基团分解)把一系列共享相同核心的分子,拆解成「核心结构 + 各连接位点的取代基(R 基团)」,从而用表格化方式系统分析构效关系(SAR)。
它怎么帮助理解 SAR
- 对齐到核心:先指定共同核心与连接位点(R1、R2…)。
- 列成表:每个分子一行,各 R 位一列,再附上活性等数据。
- 读规律:一眼看出「R1 放卤素活性升、R2 放大基团活性降」之类的趋势。
实践要点
- 需要分子能良好对齐到同一核心,混入不同骨架会失效。
- 常与可视化工具配合,把 R 基团与活性并排展示。
- 是先导优化阶段最常用的 SAR 分析手段之一。
关键要点
- R-group 分解 = 核心 + 取代基的表格化 SAR;
- 适合分析共享骨架的系列分子;
- 能直观看出「哪个位置换什么」影响活性。
延伸资源
- 实操:RDKit
rdRGroupDecomposition。 - 配套:043《MMPA 配对分子分析》、「实战流程」模块的 R-group Replacement。