药效团 Pharmacophore：从相互作用模式到虚拟筛选

药效团（pharmacophore）是对「一个分子要结合靶点，必须具备哪些关键相互作用特征、它们在空间如何排布」的抽象描述，而不限定具体原子。

药效团包含的特征

• 特征类型：氢键供体/受体、疏水中心、芳香环、正/负电中心。
• 空间约束：这些特征之间的相对距离与方向。
• 它回答「结合需要什么」，而非「必须是哪个分子」。

怎么用

• 虚拟筛选：用药效团模型在大库里匹配满足特征排布的分子。
• 骨架跃迁：保留药效团、更换骨架，寻找新化学型。
• 来源：可从已知活性分子（配体based）或口袋（结构based）构建。

延伸资源

• 配套：091《蛋白口袋》、093《形状互补》。