OpenFE(Open Free Energy)提供开源、标准化的相对结合自由能(RBFE)计算工作流,让先导优化阶段「值得精算」的自由能计算更易复现、更易落地。
它解决什么
- 工程化 RBFE:把炼金自由能的复杂流程封装成可复现的管线。
- 开源替代:相对商业 FEP+ 提供开放选项。
- 与生态衔接:基于 OpenMM、OpenFF 等开源组件。
怎么用在先导优化
- 对一系列改造分子做 RBFE,预测谁的结合更强,指导合成优先级。
- 需要可靠的结合姿势与参数化作为前提。
- 用于关键决策点的少量分子精算,而非海量初筛。
关键要点
- OpenFE = 开源、可复现的 RBFE 工作流;
- 基于 OpenMM/OpenFF 生态;
- 用于先导优化关键分子的精算。
延伸资源
- 配套:127《FEP/RBFE/ABFE》、014《OpenFF》、015《OpenMM》。