PLIP：自动生成蛋白-配体相互作用报告

PLIP（Protein-Ligand Interaction Profiler）能自动分析蛋白-配体复合物，识别其中的各类相互作用并生成报告，省去手工逐个查看。

它能识别什么

• 氢键、疏水接触、π-π 与 π-阳离子堆积；
• 盐桥、卤键、水桥等；
• 给出涉及的残基与几何参数。

怎么用

• 解读对接姿势：核对是否形成了预期的关键相互作用（见 096）。
• 对比分子：看不同分子的相互作用差异，辅助 SAR 理解。
• 有网页版与命令行/Python，便于批量。

延伸资源

• 配套：109《ProLIF》、096《Binding Pose》。