DiffDock 论文精读：扩散模型如何做盲对接

DiffDock（Corso 等, ICLR 2023）把分子对接从「搜索 + 打分」重构为「生成」问题，是扩散模型进入对接的代表作。

核心思想

• 在姿势空间扩散：在配体的平移、旋转、可旋转键扭转这几个自由度上定义扩散过程。
• 去噪生成姿势：从噪声出发逐步生成合理结合姿势。
• 置信模型：单独训练一个模型给生成姿势打置信度，用于排序。

意义与局限

• 意义：无需指定口袋（盲对接）、推理快。
• 局限：对训练分布外蛋白可能不稳；置信低时要谨慎。
• 常与传统对接交叉验证使用。

延伸资源

• 源码 github.com/gcorso/DiffDock；教程见 018。