Smina 是 AutoDock Vina 的一个分支(由 David Koes 维护),在易用性与打分灵活性上做了实用改进,长期是对接实战的常用工具。
它的改进
- 自定义打分:支持自定义打分项与权重,便于实验。
- 更好的最小化:改进了局部能量最小化。
- 易用:单文件、参数清晰,准备工作更省心。
定位
- 介于经典 Vina 与现代 Vina 1.2/GNINA 之间的实用选择。
- GNINA 实际上构建在 smina 之上(再加 CNN)。
- 适合需要灵活打分配置的研究场景。
关键要点
- Smina = Vina 分支,打分更灵活、最小化更好;
- 是 GNINA 的基础;
- 适合需要自定义打分的实战。
延伸资源
- 配套:097《Vina 论文》、099《GNINA》。