自由能微扰（FEP）及相关炼金方法，是目前预测结合自由能精度最高的一类计算手段。理解 RBFE 与 ABFE 的区别，才能用对。
三个概念
- FEP：通过「炼金」路径（逐步把一个分子变成另一个）严格地算自由能差，依赖充分采样。
- RBFE（相对结合自由能）：算两个相似分子的结合自由能差，最常用于先导优化。
- ABFE（绝对结合自由能）：算单个分子的绝对结合自由能，更难、更贵。
使用要点
- RBFE 最实用：在一个系列里比较改造方向，精度可达约 1 kcal/mol 量级（视体系而定）。
- 成本高：需要可靠结构、力场与大量采样。
- 是「值得花算力精算」的关键决策点工具，而非海量初筛工具。
关键要点
- FEP 用炼金路径精算自由能，依赖采样；
- RBFE 算相对差（最实用），ABFE 算绝对值（更难）；
- 精度高但贵，用于关键决策而非初筛。
延伸资源
- 工作流见 130《OpenFE 做 RBFE》；商业平台见「平台与公司」模块 FEP+。