MM/GBSA：快速自由能估算的优势和局限

MM/GBSA 与 MM/PBSA 思路相同，但用更快的 Generalized Born（GB）模型替代 Poisson-Boltzmann 来处理溶剂化，从而显著提速。

与 MM/PBSA 的区别

• 更快：GB 是 PB 的近似，计算量小，适合批量。
• 精度权衡：速度换来一定精度损失，结果同样偏半定量。
• 二者都属端点自由能方法。

实践要点

• 用于排序：在同一体系内对分子做相对排序较可靠。
• 别当绝对值：绝对结合自由能预测不准。
• 需要更高精度时上 FEP/RBFE（见 127、130）。

延伸资源

• 对照：125《MM/PBSA》、127《FEP》。