AlphaPulldown 是基于 AlphaFold-Multimer 的实用封装,专门用来批量做蛋白-蛋白相互作用筛选与复合物结构建模。
它做什么
- 批量配对预测:像「pulldown 实验」一样,系统预测一组蛋白两两/多组分的复合物。
- 筛相互作用:用复合物预测的置信指标筛潜在相互作用对。
- 工程化:管理大批量任务与结果。
使用场景
- 靶点机制研究里筛蛋白互作伙伴。
- 把结构预测用于「计算 pulldown」假设生成。
- 结果仍需实验验证,置信度需谨慎解读。
关键要点
- AlphaPulldown = AF-Multimer 批量复合物/互作筛选;
- 做「计算 pulldown」生成假设;
- 结果需实验验证。
延伸资源
- 配套:113《AlphaFold3》、118《ColabFold》。