ProLIF 把蛋白-配体相互作用编码成相互作用指纹（interaction fingerprint）——一串表示「哪些残基发生了哪种相互作用」的向量，便于量化比较与建模。
它的价值
- 可比较：把相互作用变成向量，能比较不同姿势/分子的相互作用模式。
- 分析 MD：统计一条轨迹中各相互作用出现的频率，看稳定性。
- 下游特征：相互作用指纹可作为模型输入特征。
典型用法
- 对接后：把姿势的相互作用指纹与已知活性分子比对。
- MD 后：看关键相互作用是否在模拟中持续存在。
- 与 PLIP 的区别：PLIP 偏「出报告」，ProLIF 偏「出可分析指纹」。
关键要点
- ProLIF = 相互作用指纹，便于量化比较；
- 可分析 MD 轨迹中相互作用的稳定性；
- 指纹可作为下游建模特征。
延伸资源
- 配套：108《PLIP》、129《MDAnalysis》、「实战流程」模块。