形状互补（Shape Complementarity）是分子结合的第一原则：配体的形状要能「嵌进」口袋。形状不匹配，再好的相互作用也无从谈起。
为什么形状先行
- 占据体积：配体需填充口袋而不发生空间冲突。
- 形状相似性筛选：把已知活性分子的三维形状作为模板，在库中找形状相似者（ROCS 类方法）。
- 不依赖骨架：形状相似可跨越不同化学型，利于骨架跃迁。
实践要点
- 形状比对依赖合理的三维构象（见 049 构象生成）。
- 常与静电互补、药效团联合，提升筛选特异性。
- 形状互补是必要非充分条件，仍需结合相互作用判断。
关键要点
- 形状互补是结合的第一前提；
- 形状相似性筛选可跨骨架找苗头；
- 需配合静电/药效团，且依赖好构象。
延伸资源
- 配套：094《静电互补》、092《药效团》。