RoseTTAFold All-Atom(RFAA)(Krishna 等, 2024)把 RoseTTAFold 扩展到全原子建模,能处理含小分子、金属、辅因子与共价修饰的复杂体系。
为什么全原子重要
- 真实靶点不只有蛋白:常含配体、辅因子、金属离子、翻译后修饰。
- 药物设计需要:把这些一起建模,才更贴近真实结合环境。
- 统一框架:在一个模型里处理多种化学实体。
意义
- 与 AlphaFold3 呼应,代表「全原子 / 多分子」结构预测趋势。
- 对含辅因子/金属的靶点尤其有价值。
- 同样要看置信度与对新体系的适应性。
关键要点
- RFAA = 全原子、含小分子/辅因子/共价修饰;
- 更贴近真实靶点环境;
- 与 AF3 同属全原子趋势。
延伸资源
- 配套:114《RoseTTAFold》、113《AlphaFold3》。