配体效率(Ligand Efficiency, LE)把活性按分子大小归一,回答「每个重原子贡献了多少结合力」。它提醒我们:优化不能只盯着 IC50。
为什么需要它
- 避免虚胖:单纯加大分子常能提升活性,但分子越变越大、越难成药。
- LE 定义:约为每重原子的结合自由能贡献,常用 LE ≈ 1.37 × pIC50 / 重原子数。
- 比较起点:片段虽弱,但 LE 往往很高,是优质起点。
怎么用
- 优化时关注 LE 是否保持或提升,而非只看绝对活性。
- 结合分子大小、脂溶性等一起判断(见 072 LLE)。
- LE 是工具不是教条,不同靶点的合理区间不同。
关键要点
- LE = 活性按重原子数归一;
- 防止「堆原子换活性」的虚胖;
- 片段 LE 高,是优质起点。
延伸资源
- 配套:072《脂溶性配体效率 LLE》、073《SAR》。