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配体效率 Ligand Efficiency:小分子优化不能只看 IC50

配体效率把活性按分子大小归一,避免「靠堆原子换活性」,是先导优化中比单看 IC50 更理性的指标。

配体效率(Ligand Efficiency, LE)把活性按分子大小归一,回答「每个重原子贡献了多少结合力」。它提醒我们:优化不能只盯着 IC50。

为什么需要它

  • 避免虚胖:单纯加大分子常能提升活性,但分子越变越大、越难成药。
  • LE 定义:约为每重原子的结合自由能贡献,常用 LE ≈ 1.37 × pIC50 / 重原子数。
  • 比较起点:片段虽弱,但 LE 往往很高,是优质起点。

怎么用

  • 优化时关注 LE 是否保持或提升,而非只看绝对活性。
  • 结合分子大小、脂溶性等一起判断(见 072 LLE)。
  • LE 是工具不是教条,不同靶点的合理区间不同。

关键要点

  • LE = 活性按重原子数归一;
  • 防止「堆原子换活性」的虚胖;
  • 片段 LE 高,是优质起点。

延伸资源

  • 配套:072《脂溶性配体效率 LLE》、073《SAR》。