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SPR 实验:结合动力学如何指导 AI 设计

SPR 无标记、实时测量结合的 kon/koff/KD,提供动力学与停留时间信息,是验证与指导 AI 设计的重要实验。

表面等离子共振(SPR,Surface Plasmon Resonance)是一种无标记、实时测量分子结合的技术。它不仅给出亲和力(KD),还能拆出结合与解离的动力学(kon、koff)。

SPR 提供什么信息

  • KD:平衡解离常数,衡量亲和力。
  • kon / koff:结合/解离速率,反映「结合多快、留多久」。
  • 停留时间(residence time):≈ 1/koff,越长往往药效越持久。

对 AI 设计的意义

  • 不止 IC50:两个 KD 相同的分子,动力学可能差别很大,药效不同。
  • 提供标签:SPR 数据可作为模型训练/验证的高质量标签。
  • 机制理解:动力学变化能反映结合模式的改变。

关键要点

  • SPR 无标记、实时,给 KD + kon/koff;
  • 停留时间(1/koff)常比 KD 更贴近药效;
  • 动力学维度是 AI 设计常忽略的信息。

延伸资源

  • 对照:075《ITC 实验》(热力学视角)。